Home  /  Jurnal Biosains  /  Vol: 6 Núm: 3 Par: 0 (2012)  /  Article
ARTICLE
TITLE

DNA BARCODING EDELWEISS (Anaphalis longifolia) ASAL SUMATERA UTARA MENGGUNAKAN SEKUEN GEN maturase K DOI : 10.24114/jbio.v6i3.22403 | Abstract views : 85 times

SUMMARY

Anaphalis longifolia merupakan anggota dari family Asteraceae yang tersebar di dataran tinggi Eropa, Amerika, hingga Asia. Penelitian tentang tanaman ini masih terbatas pada studi habitat, sedangkan penelitian terkait identifikasi molekuler masih belum dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis DNA barcode dari A. longifolia menggunakan sekuen matK gene. Sampel yang diperoleh dari Sumatera Utara kemudian di Isolasi DNA, di amplifikasi menggunakan primer spesifik, lalu disequencing. Hasil sequencing dianalisis menggunakan program Molecular Evolution Genetics Analysis (MEGA) Version X. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sekuen matK gen berhasil diamplifikasi pada panjang 800-850 kb. Hasil analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa sekuen matK gene dapat mengelompokkan A. longifolia. Pada sekuen matK gene A. longifolia, AT content lebih tinggi dibandingkan dengan GC conten. Jarak genetik yang diperoleh berkisar 0-0.0014. Hasil analisis alignment sekuen matK gene menunjukkan terdapat 1521 karakter yang dapat diamati, 1403 karakter conserved site, 118 karakter variable site, 9 karakter parsimony informative site, dan 7 karakter single nucleotide polymorphism (SNP) site. Sekuen matK gene dapat digunakan sebagai DNA barcoding untuk mengidentifikasi A. longifolia. Hasil penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi penting dalam konservasi A. longifolia.

 Articles related

Tomi Kasayev,Tuty Arisuryanti    

Selais fish belongs to the family Siluridae consisting of 12 genera with 104 properly validated species. The human need for these fish has sharply increased due to the benefits provided, especially for consumption. However, morphologically the selais fis... see more


Teddy Triandiza,Agus Kusnadi,Hawis Madduppa,Neviaty P Zamani,Udhi E Hernawan,Rosmi N Pesillette,Abdul Kadir Yamko,Nurlita P Anggraini,Fildzah Z Hulwani,Ichtineza H Hardono,Risnita Tri Utami    

AbstrakPeran penting kerang Kima secara ekologis sebagai salah satu spesies kunci dalam ekosistem terumbu karang menyebabkan biota laut ini mengalami tekanan antropogenik di sebagian besar wilayah di Indo-Pasifik, termasuk Indonesia. Penelitian ini bertu... see more


Mukhamad Su'udi,Dyah Wulan Budyartini,Zakiyah Ramadany    

AbstrakDendrobium linearifolium Teijsm. & Binn. merupakan salah satu spesies anggrek yang telah dimanfaatkan sebagai obat herbal tradisional di Bali. Bagian pseudobulb dari D. linearifolium dimanfaatkan oleh masyarakat Bali untuk mengobati sakit teli... see more


Anna Rejeki Simbolon,Masteria Yunovilsa Putra,Ismiliana Wirawati    

Teripang merupakan komoditas perikanan yang saat ini dibudidayakan dan dieksploitasi di perairan Lampung. Namun terdapat kesulitan dalam mengidentifikasi teripang karena kemiripan morfologis di antara spesies yang ada. Identifikasi yang baik berguna agar... see more


APARNA SURESHCHANDRA KALAWATE,K. P. DINESH,A. SHABNAM    

The genus Olepa is distributed in Palearctic and Oriental regions with more species in India and Sri Lanka. In the recent studies, morphological variations within the group were well established, with couple of first set of mt COI DNA barcodes for at lea... see more