ARTICLE
TITLE

Validasi Metode Real-Time Polymerase Chain Reaction untuk Deteksi DNA Babi (Sus Scrofa Domestica) dan Celeng (Sus Barbatus) pada Sosis Sapi

SUMMARY

Babi (Sus scrofa domestica) dan celeng (Sus barbatus) hewan satu spesies yang  memiliki kemiripan sangat tinggi, perbedaan keduanya dilihat dari susunan basa DNA yang dimiliki. Metode analisis DNA antara babi dan celeng banyak yang belum berhasil membedakan kedua spesies tersebut seperti pada penelitian yang dilakukan Hikmah (2019) untuk membedakan babi dan celeng menggunakan primer Nk-ND1 dengan metode real time PCR namun berhasil mendapatkan perbedaan basa antara fragmen DNA babi dan celeng dari hasil sekuensing sehingga perbedaan urutan basa tersebut dijadikan sebagai primer spesifik babi untuk membedakan kedua spesies babi dan celeng dengan metode real time PCR. Lima spesies hewan yang digunakan yaitu babi, celeng, sapi, kambing dan ayam, primer babi forward 5’-GATGCCCTAAAACTATTCACC-3’ dari hasil sekuensing dan primer babi reverse yaitu 5’-TAGTGCTAGGGATAAGGCTAGG-3’ desain Hikmah (2019), SsoFast™ EvaGreen® Supermix (Bio-Rad), proteinase-K (Invitrogen), isolasi DNA menggunakan Geneaid Genomic DNA Mini Kit. Validasi metode real time PCR dengan uji spesifitas primer terhadap 5 isolat DNA jaringan segar, uji efisiensi dan sensitivitas pada 6 konsentrasi DNA (50; 5; 0,5; 0,05; 0,005 dan 0,0005 ng) dan sosis referensi campuran daging sapi:babi (100%; 50%; 25%; 10%; 5% dan 1%), uji keterulangan dilakukan sebanyak 5 kali replikasi. Hasil analisis menunjukkan sepasang primer spesifik terhadap DNA babi dan celeng. Efisiensi DNA babi yaitu 109,5% dan R2 = 0,967, efisiensi celeng 99,1% dan R2 = 0,999. Batas deteksi absolut DNA babi dan celeng yaitu 0,05 ng/µL dan 0,5 ng/µL, batas deteksi relatif sosis babi yaitu 5% dan sosis celeng 1%. Nilai RSD rata-rata pada analisis keterulangan DNA babi dan celeng yaitu 4,210% dan 3,611%. Pada sampel tidak terdteeksi adanya DNA babi dan celeng, secara kuantitatif metode ini tidak memenuhi persyaratan validasi.

 Articles related

Ibrohim Fathurrosi, Sri Marmoah, Sularmi Sularmi, Tri Wahyu Handono    

Tujuan dari penelitian adalah untuk mengembangkan pembelajaran motif batik Ngawi berbasis audio visual sebagai media pengenalan batik Ngawi di Sekolah Dasar. Pengembangan media pembelajaran ini didasarkan pada keterbatasan media pembelajaran pada materi ... see more


Jejen Jaenudin, Ade Surya Wirawan, Fitri Zakiah    

Penelitian ini dilatarbelakangi oleh adanya kesenjangan antara pemahaman bahwa sesungguhnya pelayanan farmasi yang dilakukan di beberapa apotek menuntut adanya profesionalisme tapi berseberangan dengan kenyataan dengan motivasi konsumen dalam memilih apo... see more


Tatang Ibrahim,Fahmi Azkia Abdullah    

Setiap manusia pada dasarnya memiliki tingkat pemahaman yang berbeda-beda, begitu pula banyak guru yang masih belum memahami sistem yang digunakan pemerintah untuk guru agama melalui aplikasi SIAGA. Aplikasi SIAGA adalah aplikasi untuk validasi dan verif... see more


Nur Hafidza,Lutfi Syauki Faznur    

Penelitian ini dilatarbelakangi oleh responsif peserta didik dalam belajar rendah sehingga menyebabkan kurangnya pemahaman terhadap materi pembelajaran. Sebab kegiatan belajar yang tidak beragam mengakibatkan peserta didik mudah bosan. Sehingga peneliti ... see more


Putri Ardhillah,M Joharis Lubis    

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk: 1) membuat bahan ajar berbentuk leaflet pada pelajaran Bahasa Indonesia pokok pembahasan teks ulasan; 2) menganalisis kelayakan leaflet untuk bahan ajar pembelajaran bahasa Indonesia pada teks ulasan di kelas VIII... see more