Caracterização molecular de plantéis de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus L.) em Santa Catarina, Brasil

Autores

  • Gustavo Emygdio Halfen Departamento de Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia; Universidade Federal do Paraná; 81531-970; Curitiba - PR.
  • Maycon Eduardo Nicoletti
  • Henrique B. Appel
  • Fernando Adami Tcacenco
  • Gustavo Emygdio Halfen Universidade Federal do Paraná
  • Maycon Eduardo Nicoletti Epagri - Estação Experimental de Itajaí
  • Henrique Appel Programa de Piscicultura - Estação Experimental de Itajaí
  • Fernando Adami Tcacenco Epagri - Estação Experimental de Itajaí

DOI:

https://doi.org/10.20873/jbb.uft.cemaf.v3n2.halfen

Palavras-chave:

Caracterização molecular, Oreochromis niloticus, divergência genética, RAPD

Resumo

Com o aumento da demanda de produção de alimentos na atualidade, a aquicultura tem um papel promissor na contribuição da oferta de alimentos. Merece destaque o cultivo de tilápias, cuja produção mundial ultrapassou dois milhões de toneladas, sendo o segundo maior grupo de peixes produzidos pela aquicultura, ficando apenas atrás das carpas. A espécie mais cultivada é a tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus Linnaeus, 1758), devido principalmente à alta prolificidade, crescimento rápido e boa aceitação do consumidor, características buscadas com o melhoramento genético. O melhoramento genético de peixes cultivados tem tido como uma de suas bases os progressos obtidos na área da genética molecular. O conjunto de métodos desenvolvidos nessa ciência nas últimas décadas possibilitou, com sua incorporação na aqüicultura, ganhos consideráveis, particularmente quando aplicados no melhoramento genético assistido por marcadores moleculares. A diversidade genética em populações de tilápias pode ser determinada através de marcadores moleculares como do tipo RAPD. O presente trabalho visou ao levantamento da variabilidade genética existente entre as quatro populações de tilápia do Nilo que formam o Núcleo Satélite de Tilápia do Nilo do Estado de Santa Catarina, parte da UMGEP - Unidade de Melhoramento Genético de Peixes da Epagri/Itajaí, e à busca de marcadores moleculares de identificação das diferentes linhagens da espécie, para aplicação no melhoramento genético assistido por marcadores. Para tanto, foram conduzidos experimentos de otimização do protocolo de extração de DNA (Bardakci e Skibinski, 1994), obtendo assim DNA de boa qualidade. Em seguida foram selecionados 20 indivíduos de cada uma das linhagens (Bouaké, Chitralada, GST e GIFT), e foram testados oito iniciadores de RAPD. Posteriormente os fragmentos amplificados foram submetidos à análise pelos programas NTSys e Popgen. Em análise intrapopulacional, a linhagem GIFT foi a mais polimórfica em relação às outras, obtendo maior numero de lócus polimórficos (37%) e o maior índice de Shannon (0,17). Todos os iniciadores apresentaram bandas exclusivas podendo ser usadas como marcadores moleculares na diferenciação das linhagens, com exceção do iniciador OPA-12 para a população Chitralada. O dendrograma obtido com o agrupamento UPGMA apresentou separação clara das linhagens, agrupando-as conforme os índices genéticos, onde as linhagens GIFT e Chitralada tiveram a maior identidade genética (0,88) e as linhagens GIFT e GST tiveram as maiores distâncias genéticas (0,23).

 

Referências

Bardakci, F. e Skibinski, D. O. F. (1994), Aplication of the RAPD technique in tilapia fish: species and subspecies identification. Heredity, 73, 117-132.

Boll, M. G.; Roczansky, M.; Gazolla, A. C. (2004), A produção de peixes cultivados na região Litoral norte de Santa Catarina, Brasil (1996- 2002): Resultados e tendências. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE AQÜICULTURA E BIOLOGIA AQUÁTICA, I, Vitória - ES. Anais. 361p.

Brasileiro, A. C. M. (1998), Neomicina Fosfotransferase II (NPT II). In: Brasileiro, A. C. M e Carneiro, V. T. C. Manual de Transformação Genética de Plantas, EMBRAPA-SPI/EMBRAPA- CENARGEN, Brasília, Brazil, 143-154.

Castagnolli, N. (1992), Piscicultura de água doce. Jaboticabal: FUNEP, 189p.

Frackman S, Kobs G, Simpson D, Storts D (1998), Betaine and DMSO: Enhancing Agents for PCR. Promega Notes, 27p.

Halfen, G. E.; Nicoletti, M. E.; Appel, H. B.; Tcacenco, F. A. (2008a), Otimização na extração de DNA de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus): período de incubação versus qualidade e concentração de DNA. In: Aquaciência, 2008, Maringá, PR. CD-ROOM.

Halfen, G. E.; Nicoletti, M. E.; Appel, H. B.; Tcacenco, F. A. (2008b), Modificações no protocolo de extração de DNA de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) visando à integridade do material genético. In: Aquaciência, 2008, Maringá, PR. CD-ROOM.

IBAMA, (2008), Estatística de Pesca 2006 - Brasil: Grande regiões e unidades da federação. Brasília, 174p.

Kubitza, F. (2000), Tilápia: Tecnologia e planejamento na produção comercial. Jundiaí, 285p.

Kubitza, F. (2005), Tilápia em água salobra: uma boa alternativa de cultivo. Panorama da Aquicultura, 15, 14-18.

Lopera-Barrero, N. M.; Ribeiro, R. P.; Sirol, R. N.; Povh, J. A.; Gomes, P. C.; Vargas, L.; Streit Jr., D. P. (2006), Genetic diversity in piracanjuba populations (Brycon orbignyanus) with the RAPD (Random Amplified Polimorphic DNA) markers. Journal of Animal Science, 84, 170-170.

Lupchinski Jr, E. Avaliação da composição genética de linhagens de tilápia do Nilo (oreochromis niloticus) e de gerações G0 e F1 da linhagem GIFT. Tese (Doutorado em Zootecnia) - Universidade Estadual de Maringá, 2007.

Massago, H. Desempenho de alevinos de quatro linhagens da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) e análise da variabilidade genética pelos marcadores RAPD. Dissertação (Mestrado em Aquicultura) - Universidade Estadual Paulista, 2007.

Mather, P. B. (2001), Overview of fish genetics research at Queensland University of Technology, 133-139. In: Gupta, M. V. e Acosta, B. O. Fish genetics research in member countries and institutions of the International Network on Genetics in Aquaculture. Brisbane: ICLARM, 64- 179.

Miller, S. A.; Dikes, D. D.; Pololesky, H. F. (1988), A simple salting out procedure of extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research, 16, 12-15.

Moreira, H. L. M. Análise da estrutura de populações e diversidade genética de estoques de reprodutores de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) estimadas por microssatélite. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 1999.

Nei, M. (1978), Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 89, 583-590.

Povh, J. A.; Moreira, H. L. M.; Ribeiro, R. P.; Prioli, A. J.; Vargas, L.; Blanck, D. V.; Gasparino, E.; Streit Jr, D. P. (2005), Estimativa da variabilidade genética em linhagens de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) com a técnica de RAPD. Acta Scientiarum Animal Sciences, 27, 1- 10.

Rohlf, F. J. NTSYS-Pc: Numerical taxonomy and multivariate analysis system. New York: Exeter Publishers, 1989.

Downloads

Publicado

16-05-2012

Como Citar

Halfen, G. E., Nicoletti, M. E., Appel, H. B., Tcacenco, F. A., Halfen, G. E., Nicoletti, M. E., … Tcacenco, F. A. (2012). Caracterização molecular de plantéis de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus L.) em Santa Catarina, Brasil. Journal of Biotechnology and Biodiversity, 3(2), 21–29. https://doi.org/10.20873/jbb.uft.cemaf.v3n2.halfen